服务概述
转录组测序以高通量测序为核心,全面测定样本在特定状态下的基因表达谱,用于差异表达分析、可变剪接分析及非编码RNA(LncRNA、CircRNA、Small RNA)鉴定。覆盖原核转录组、真核短读长转录组、全长转录组与全转录组等多种方案。转录调控网络(顺式元件、反式因子、表观修饰、染色质构象等)作为延伸应用方向,可在此基础上进一步拓展。相关服务仅供科研用途。
样本与送样要求
- 细胞/组织样本:起始量按文库类型确定。【送样量待客户以验证数据确认】
- RNA起始量:按文库类型分档(mRNA-seq / 链特异性 / small RNA)给出。【起始量待客户以验证数据确认】
- 质量要求:RIN 及 260/230 达标(260/280 仅反映蛋白污染,不代表完整性与得率)。【具体阈值待客户确认】
项目周期
整体实验周期以项目方案确认为准(工作日)。【周期天数待客户确认】
应用场景
差异表达与通路分析
比较不同分组的基因表达差异,进行功能富集与通路分析。
可变剪接与非编码RNA
解析可变剪接事件及 LncRNA、CircRNA、Small RNA 表达谱。
疾病机制与标志物发现
从转录层面研究疾病发生机制,发现候选生物标志物(科研用途)。
药物响应转录特征
刻画药物处理前后的转录组响应特征,支持机制研究。
服务流程
01
RNA质检
评估 RNA 完整性(RIN)与纯度,判定是否满足建库要求。
02
文库构建
按文库类型(mRNA-seq / 链特异性 / small RNA 等)构建测序文库。
03
上机测序
高通量测序平台完成上机测序。
04
数据质控与比对
原始数据质控、过滤,并与参考基因组比对。
05
表达定量与差异分析
基因/转录本表达定量,差异表达与功能分析。
06
报告交付
交付分析报告、原始数据与定制化图表。
