高通量测序

单细胞转录组+VDJ联合测序

在单细胞分辨率下,同步获取基因表达谱与TCR/BCR V(D)J重排序列,精准解析免疫微环境异质性与克隆动态。

服务概述

高通量单细胞转录组及V(D)J测序技术的核心主要涉及到捕获单个免疫细胞的转录组信息(5' Gene Expression)与T细胞受体(TCR)和B细胞受体(BCR)的表达谱分析(V(D)J Enrichment),在单细胞层面实现基因表达与克隆型的联合分析。可识别肿瘤浸润淋巴细胞(TIL)亚群、追踪抗原特异性克隆扩增、评估T/B细胞功能状态。

10x Genomics 单细胞 5' 基因表达与 V (D) J 免疫文库构建完整流程图

技术优势

一站式高通量单细胞测序

基于10x Genomics、BD、DNBelab C4等国内外多种单细胞测序捕获平台,提供从组织消化到结果分析的一站式单细胞测序解决方案。

丰富的组织样本解离经验

专注于肿瘤科研领域,有丰富的组织解离经验。按组织解离难度覆盖常规组织与难解离组织:常规组织可高效解离,脂肪、血管、胰腺等难解离组织通过技术优化保障单细胞悬液质量(涉及胃癌、肺癌、肠癌等多种癌种研究)。

多组学联合解析

单细胞转录组+V(D)J同步获取,还可以搭配单细胞蛋白质组,多组学联合分析服务,一次实验同时解析基因功能、克隆多样性及蛋白功能,助力科研成果加速转化。

应用场景

肿瘤免疫微环境

解析TME中T/B细胞亚群分布、耗竭状态与肿瘤反应性克隆。

自身免疫分型

鉴定自免疾病中异常扩增的T/B细胞克隆,辅助靶向治疗设计。

疫苗免疫应答评估

追踪疫苗接种前后抗原特异性T/B细胞的克隆扩增与表型变化。

CAR-T/TCR-T质控

辅助评估工程化T细胞产品的克隆均一性与功能状态(科研用途)。

服务流程

01

样本接收

验收细胞或组织样本,评估活率与细胞数量。

02

细胞质控

细胞计数法(台盼蓝/AO-PI)评估活率,建议≥85%;必要时行死细胞去除(磁珠去除或FACS分选)。

03

文库构建

10x微流控捕获单细胞,同步构建GEX+VDJ文库。

04

上机测序

Illumina高通量测序,目标每细胞平均测序量按项目设定(GEX与VDJ文库分别设定),以质控结果为准。【测序深度数值待客户以验证数据确认】

05

生信分析

Cell Ranger+Seurat流程,输出聚类、差异分析及克隆型报告。

06

结题报告

提供PDF分析报告、原始数据及定制化图表,支持发表级质量;标准交付周期以项目方案确认为准(工作日)。【周期天数待客户确认】

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