服务概述
微生物组测序涵盖扩增子测序与宏基因组测序两大类方案。扩增子测序(16S rRNA 用于细菌/古菌、18S rRNA 用于真核微生物、ITS 用于真菌)通过靶向保守区快速获得群落物种组成与多样性,成本低、通量高,但分辨率通常止于属/种水平;宏基因组测序直接提取样本内整个微生物群落的总DNA,进行大规模测序与生物信息学分析,可获得更高的物种分辨率并解析基因功能与代谢通路,突破了传统分离纯化培养的局限。
可根据研究目标选择相应策略:以群落结构与多样性快速普查为主时采用扩增子;需物种精细分辨、功能基因与代谢网络分析时采用宏基因组。配套方案还包括三代全长扩增子测序与宏转录组测序(分析群落活性表达)。
各方案的适用场景与分辨率不同,实际选择需结合样本类型、生物量与研究问题综合确定。相关服务仅供科研用途。
样本与送样要求
- 样本量按样本类型分档(粪便/土壤/拭子/血浆等,低生物量样本另行评估)。【送样量待客户以验证数据确认】
- 核酸量按方法分档(16S/宏基因组/宏转录组);宏转录组需 RNA 并评估完整性。【核酸量待客户以验证数据确认】
项目周期
整体实验周期以项目方案确认为准(工作日)。【周期天数待客户确认】
技术优势
免分离培养
直接提取微生物群落总核酸,无需分离培养。
多类群覆盖
可覆盖细菌、古菌、真菌、病毒等多类群;实际鉴定深度与分辨率取决于样本类型、测序策略与数据库。
信息分析全面
除物种信息挖掘外,还可获得群落功能基因与代谢通路信息等。
快速高效大样本
可快速、高效、大样本地对微生物群落进行分析。
应用场景
肠道菌群与疾病
研究肠道菌群结构变化与宿主健康、疾病表型的关联(科研用途)。
环境微生物
解析土壤、水体等环境样本的微生物群落组成与功能。
多样性与功能通路
评估群落多样性并分析功能基因与代谢通路富集。
物种分类与注释
对群落进行物种分类、系统进化与丰度注释。
服务流程
01
核酸提取
从样本中提取微生物群落总核酸并质检。
02
扩增/建库
按方案进行靶区扩增(扩增子)或宏基因组文库构建。
03
上机测序
高通量测序平台完成上机测序。
04
注释分析
扩增子进行 OTU/ASV 聚类注释;宏基因组进行组装、基因预测与物种/功能注释。
05
多样性与功能分析
群落多样性、物种组成、功能通路与代谢网络分析。
06
报告交付
交付分析报告、原始数据与定制化图表。
