高通量测序

微生物组测序

扩增子(16S/18S/ITS)与宏基因组测序,解析多部位微生物群落结构与功能。相关服务仅供科研用途。

服务概述

微生物组测序涵盖扩增子测序与宏基因组测序两大类方案。扩增子测序(16S rRNA 用于细菌/古菌、18S rRNA 用于真核微生物、ITS 用于真菌)通过靶向保守区快速获得群落物种组成与多样性,成本低、通量高,但分辨率通常止于属/种水平;宏基因组测序直接提取样本内整个微生物群落的总DNA,进行大规模测序与生物信息学分析,可获得更高的物种分辨率并解析基因功能与代谢通路,突破了传统分离纯化培养的局限。

可根据研究目标选择相应策略:以群落结构与多样性快速普查为主时采用扩增子;需物种精细分辨、功能基因与代谢网络分析时采用宏基因组。配套方案还包括三代全长扩增子测序与宏转录组测序(分析群落活性表达)。

各方案的适用场景与分辨率不同,实际选择需结合样本类型、生物量与研究问题综合确定。相关服务仅供科研用途。

样本与送样要求

  1. 样本量按样本类型分档(粪便/土壤/拭子/血浆等,低生物量样本另行评估)。【送样量待客户以验证数据确认】
  2. 核酸量按方法分档(16S/宏基因组/宏转录组);宏转录组需 RNA 并评估完整性。【核酸量待客户以验证数据确认】

项目周期

整体实验周期以项目方案确认为准(工作日)。【周期天数待客户确认】

技术优势

免分离培养

直接提取微生物群落总核酸,无需分离培养。

多类群覆盖

可覆盖细菌、古菌、真菌、病毒等多类群;实际鉴定深度与分辨率取决于样本类型、测序策略与数据库。

信息分析全面

除物种信息挖掘外,还可获得群落功能基因与代谢通路信息等。

快速高效大样本

可快速、高效、大样本地对微生物群落进行分析。

应用场景

肠道菌群与疾病

研究肠道菌群结构变化与宿主健康、疾病表型的关联(科研用途)。

环境微生物

解析土壤、水体等环境样本的微生物群落组成与功能。

多样性与功能通路

评估群落多样性并分析功能基因与代谢通路富集。

物种分类与注释

对群落进行物种分类、系统进化与丰度注释。

服务流程

01

核酸提取

从样本中提取微生物群落总核酸并质检。

02

扩增/建库

按方案进行靶区扩增(扩增子)或宏基因组文库构建。

03

上机测序

高通量测序平台完成上机测序。

04

注释分析

扩增子进行 OTU/ASV 聚类注释;宏基因组进行组装、基因预测与物种/功能注释。

05

多样性与功能分析

群落多样性、物种组成、功能通路与代谢网络分析。

06

报告交付

交付分析报告、原始数据与定制化图表。

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