基因编辑

脱靶检测

CRISPR编辑脱靶位点全基因组无偏检测,保障基因编辑安全性。

服务概述

CRISPR/Cas 编辑在基因组中除目标位点外,可能于序列相似区域产生非预期的双链断裂与突变,即脱靶效应,是基因编辑安全性评估的重要指标。

河维欧采用候选位点发现与靶向深度验证相结合的策略,整合基于细胞的 GUIDE-seq 与体外 DNA 切割方法 CIRCLE-seq / Digenome-seq 及生物信息预测,在既定检测范围内评估潜在脱靶事件并量化编辑频率。对于核酸酶、碱基编辑与先导编辑等不同编辑体系,候选发现、靶向验证与风险评价策略按其作用机制分别设计,为基因编辑项目的研究性安全评价提供数据支持。

技术优势

候选发现 + 靶向验证

结合基于细胞的 GUIDE-seq 与体外 DNA 切割方法 CIRCLE-seq / Digenome-seq 发现候选位点,并在目标细胞中靶向深度验证,兼顾灵敏度与生理相关性。

按编辑体系分流

核酸酶(DSB)、碱基编辑与先导编辑的脱靶与产物谱风险不同,检测与风险评价策略按机制分别设计;不同方法各有适用条件与偏倚,组合使用可拓展候选发现范围。

可量化评估

基于二代测序与 UMI 校正评估候选脱靶事件频率;具体检出下限以实验设计与检测范围为准。

应用场景

编辑安全研究

为基因编辑项目的研究性安全评价及申报策略设计提供数据支持(具体申报要求以监管沟通为准)。

sgRNA 优选

比较候选 sgRNA 的脱靶谱,指导编辑方案设计。

编辑系统评估

评估不同 Cas 变体、高保真酶及递送方式对脱靶谱的影响。

机制研究

解析脱靶产生规律与 DNA 修复结局。

服务流程

01

需求沟通

明确研究目标、样本类型与检测需求

02

方案设计

定制实验设计、技术路线与交付标准

03

样本接收

样本质检、登记与标准化前处理

04

实验执行

标准化建库 / 分选 / 测序等实验操作

05

数据分析

生物信息分析与特征解析

06

报告交付

交付分析报告与原始数据

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