服务概述
CRISPR/Cas 编辑在基因组中除目标位点外,可能于序列相似区域产生非预期的双链断裂与突变,即脱靶效应,是基因编辑安全性评估的重要指标。
河维欧采用候选位点发现与靶向深度验证相结合的策略,整合基于细胞的 GUIDE-seq 与体外 DNA 切割方法 CIRCLE-seq / Digenome-seq 及生物信息预测,在既定检测范围内评估潜在脱靶事件并量化编辑频率。对于核酸酶、碱基编辑与先导编辑等不同编辑体系,候选发现、靶向验证与风险评价策略按其作用机制分别设计,为基因编辑项目的研究性安全评价提供数据支持。
技术优势
候选发现 + 靶向验证
结合基于细胞的 GUIDE-seq 与体外 DNA 切割方法 CIRCLE-seq / Digenome-seq 发现候选位点,并在目标细胞中靶向深度验证,兼顾灵敏度与生理相关性。
按编辑体系分流
核酸酶(DSB)、碱基编辑与先导编辑的脱靶与产物谱风险不同,检测与风险评价策略按机制分别设计;不同方法各有适用条件与偏倚,组合使用可拓展候选发现范围。
可量化评估
基于二代测序与 UMI 校正评估候选脱靶事件频率;具体检出下限以实验设计与检测范围为准。
应用场景
编辑安全研究
为基因编辑项目的研究性安全评价及申报策略设计提供数据支持(具体申报要求以监管沟通为准)。
sgRNA 优选
比较候选 sgRNA 的脱靶谱,指导编辑方案设计。
编辑系统评估
评估不同 Cas 变体、高保真酶及递送方式对脱靶谱的影响。
机制研究
解析脱靶产生规律与 DNA 修复结局。
服务流程
01
需求沟通
明确研究目标、样本类型与检测需求
02
方案设计
定制实验设计、技术路线与交付标准
03
样本接收
样本质检、登记与标准化前处理
04
实验执行
标准化建库 / 分选 / 测序等实验操作
05
数据分析
生物信息分析与特征解析
06
报告交付
交付分析报告与原始数据
